MISO (Mieszanina izoform) jest probabilistyczny ramy napisany w Pythonie, które quantitates poziomu ekspresji & nbsp; od genów z alternatywnego składania RNA Seq danych, oraz określa izoformy różnie regulowane lub eksonów całej próbki.
Modelowania procesu generatywny pomocą którego odczytuje są wytwarzane z izoform w RNA sekwencji, MISO wykorzystuje Model Bayesowski wnioskowanie obliczyć prawdopodobieństwo odczytu pochodzi z danej izoformy.
MISO używa sugerowane przypisanie czyta izoformy do ilościowej na obfitość podstawowej zestaw alternatywnych izoformy mRNA. Przedziały ufności ponad szacunków można uzyskać, które ilościowo wiarygodność szacunków.
Proszę zobaczyć http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ do instrukcji MISO i dokumentacji
Wymagania .
- Python
Komentarze nie znaleziono