MACS2

MACS2 jest model oparty narzędzie analizy danych CHIP-seq.
Z poprawą technik sekwencjonowania, chromatyny immunoprecypitatacji następnie wysokiej sekwencjonowania (CHIP-SEQ) jest coraz bardziej popularne studiować całego genomu oddziaływań białko-DNA. Aby rozwiązać problem braku potężnej metody analizy CHIP-sekwencji, prezentujemy nowy algorytm o nazwie Analiza modelowych CHIP-Seq (MAC), identyfikacji miejsc wiązania czynnika transkrypcji. MACS oddaje wpływ genomu złożoności do oceny istotności wzbogaconych regionach Chip, jak i Mac poprawia rozdzielczość przestrzenną miejsca wiązania poprzez łączenie informacji zarówno pozycji znacznika sekwencjonowania i orientacji. . MACS może być łatwo wykorzystane do danych CHIP-seq samodzielnie lub z próby kontrolnej ze wzrostem określoności

Wymagania :

• Python