CWC Simulator

CWC Simulator jest C ++ wdrożenie CWC, w rachunku dla reprezentacji i symulacji systemów biologicznych. & Nbsp; Po zakończeniu instalacji (patrz Instalacja) będziesz w stanie uruchomić symulacje ponad modeli CWC, jak pokazano na przykładach, (patrz przykłady /).
(linia poleceń) Interfejs
Jako ogólne użytkownika, należy uruchomić:

-i model.cwc
Statystyki> -o <
-t
-s
-n
Klastry> -c <
--qt-threshold
-q
-w
Gdzie:
- to nazwa pliku wykonywalnego (domyślnie: scwc);
& Nbsp; - model.cwc jest wejście CWC Program (patrz przykłady);
& Nbsp; - statystyki jest prefiks wyjścia-files;
& Nbsp; - jest limit czasu symulacji;
& Nbsp; - jest okres próbkowania (czyli 0,12 zdobyć 250 punktów w terminie = 30);
& Nbsp; - jest liczba przypadków symulacji;
& Nbsp; - jest liczbą klastrów k-średnich
& Nbsp; - jest grupowanie próg QT
& Nbsp; - to numer kwantyli;
& Nbsp; - zwykle musi odpowiadać liczbie rdzeni systemu (tj 4 dla czterech rdzeni procesora).
Wyjście
Narzędzie produkuje:
- Niektóre pliki .dat (próbą wyjścia z symulacji)
- Niektóre skrypty Gnuplot zwrócić analysises statystycznych
Pracujemy na kompleksowej instrukcji

Opis .

• Algorytm Gillespie SSA nad modelami CWC
• Hybrid stochastyczne / deterministyczne semantyka
• Wiele wystąpień symulacji z statystyk internetowych
• Optymalizacja architektur wielordzeniowych na podstawie ram FastFlow
• Extensible ramy statystyczne (średnia, wariancja, sączy klastrów itp.)
• Wiele semantyka ocena (akcja masowa, Michaelis-Menten, Hill, itp.)