Szczegóły programowe:
Systemy Biologia Markup Language (SBML) Opis jest oparty na XML język do reprezentowania modeli obliczeniowych w biologii systemów i bioinformatyka.
Możliwości KEGG2SBML są obecnie ograniczone do konwersji tylko pliki KEGG szlak metaboliczny, a nie inne typy plików KEGG.
KEGG2SBML może konwertować KEGG Ścieżka bazy danych Release 46.0 lub nowszej. (Past wersje KEGG Pathway bazy danych nie zostały przetestowane i nie mogą być zamienione przez KEGG2SBML.)
Może generować SBML poziom 1 i 2 (wersja 1), z lub bez adnotacji używanych przez CellDesigner i SBML Level 2 w wersji 2 i Level 2 Wersja 3 bez adnotacji.
Co nowego w tym wydaniu:.
- Zmiany w parsowania KEGG Ścieżka
- Zmiany w parsowania KEGG LIGAND.
- Zmiany w piśmie SBML.
- KGML nie jest już stosowany od tej wersji.
Komentarze nie znaleziono