profil białko-białko i ligand-białko interakcje w postaci wykresów (sieci), gdzie biocząsteczki są reprezentowane jako węzły i ich interakcje są reprezentowane jako linki, jest obiecującym podejściem do zintegrowania wyniki doświadczalne z różnych źródeł w celu uzyskania systematyczne zrozumienie mechanizmów molekularnych jazdy fenotyp komórek. Pojawienie się sieci sygnalizacyjnych na dużą skalę stanowi okazję dla topologicznej analizy statystycznej, natomiast wizualizacja takich sieci stanowi wyzwanie. SAVI realizuje standardowe metody do obliczenia klastrowe, dystrybucję połączeń i wykrywania, a także wizualizacji, motywów sieciowych. Dodatkowo SAVI generuje kompletną stronę z zestawów danych sieciowych w formacie tekstowym. SAVI zawiera narzędzie o nazwie PathwayGenerator. To narzędzie tworzy mapy połączeń jak stron z dużych tabel opisujących interakcje sygnalizacji komórkowej. SAVI może również tworzyć sieci z listy nazw genów / białek
Wersja 2.5 może to nieokreślone aktualizacje, rozszerzenia lub poprawki błędów
Wymagania ..
System Windows (wszystkie)
Komentarze nie znaleziono