compsort

Narzędzie wiersza poleceń do porównywania plików danych oddzielonych przecinkami za pomocą różnic w stosunku do określenia najbardziej podobne konformacji. Compsort porównuje pliki danych za pomocą względnej różnicy, oblicza wynik podobieństwa, sortuje wyniki w porządku rosnącym (niższe wartości oznaczają większe podobieństwo), oszczędza X liczba niskie wyniki.
Pliki danych produkowane przez użytkownika, muszą być rozdzielane przecinkami pliki tekstowe. Każdy plik stanowi unikalne cząsteczki. Każdy wiersz pliku przedstawia unikalną konformacji cząsteczki. Pierwsza kolumna w pliku danych muszą być unikalne etykiety dla konformacji przedstawionego rzędu. Pozostałe kolumny są deskryptory liczbowe, takie jak pomiary kosmicznych odległości.
Wiersze są porównywane kombinatorycznie między plikami. Etykiety w porównaniu są łączone i zapisywane wraz z wynikami na zestaw wierszy. Zapewnia to sposób na znalezienie konformacji, które produkowane daną ocenę podobieństwa.

Przyszłość pracy obejmuje:

• dodanie graficzny interfejs
• opublikowania papier na moim algorytmu modelowania 3D Farmakofor
• równoległa wersja za pomocą MPI

Co nowego w tym wydaniu:

• Naprawiono kilka drobne ostrzeżenia kompilatora
  
• dodanej raportowania czasu obliczeniowego dla zestaw kombinatorycznych obliczeń oprócz wcześniej zgłoszonych czasie sortowania
  
• wzrósł poziom optymalizacji kompilatora binarnego

Wymagania :

System Mac OS X 10.3