KROKI jest pakiet dla dokładnej symulacji stochastycznych systemów reakcji dyfuzji w dowolnie złożonych geometrii 3D. Nasz algorytm symulacji rdzeń jest realizacja Gillespie SSA, przedłużony do czynienia z dyfuzją cząsteczek ponad elementami 3D...
tapir jest narzędziem, które zawiera programy w Pythonie do oszacowania i wykreślić filogenetycznego informatywności dla dużych zbiorów danych. Powołując tapir Podczas korzystania tapir, proszę przytoczyć:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapir zapewnia...
PicMe jest pakiet Pythona, który zawiera programy do oszacowania i wykreślić filogenetycznego informatywności dla dużych zbiorów danych. instalacji Na razie Najprostszym sposobem zainstalowania programu jest:git clone git:...
tigreBrowser gen przeglądarka jest wyrażenie modelu wynika z pakietem R tigre (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Instalacja: tigreBrowser wymaga Pythona w wersji> = 2.5. tigreBrowser można zainstalować za pomocą...
checkmyclones jest oprogramowanie, które dostarcza narzędzi, by sprawdzić Sanger wyniki sekwencjonowania. & Nbsp; (lub zwykły tekst lub pliki FASTQ) w oparciu o zestaw sekwencji odniesienia, o ile w każdym rozsądnym formacie (w tym współrzędnych) ...
Syntainia to innowacyjna aplikacja do wizualizacji wielu genomów. & Nbsp; Prezentuje prosty i intuicyjny interfejs użytkownika do przeglądania i manipulowania relacje między grupami genów. Jaśniejszej wizualizacji genu, łatwiej jest dla badacza...
CWC Simulator jest C ++ wdrożenie CWC, w rachunku dla reprezentacji i symulacji systemów biologicznych. & Nbsp; Po zakończeniu instalacji (patrz Instalacja) będziesz w stanie uruchomić symulacje ponad modeli CWC, jak pokazano na przykładach, (patrz...
AREM jest oparty na komputerach Mac (Model analizy opartej na CHIP-seq danych).Sekwencjonowanie wysokiej przepustowości w połączeniu z chromatyny immunoterapii atmosferyczne (ChIP-Sekw) jest szeroko stosowany w charakteryzowaniu genome-wide wzorców...
AHREA jest pobrania pakiet sprawia, że znalezienie względną ekspresję uczących łatwe. . Jest napisany w Pythonie Wymagania : ...
System E-Cell jest koncepcja budowy komórek wirtualnych na komputerach.Układ E-Cell jest pakiet oprogramowania obiektowego modelowania, symulacji i analizy złożonych systemów na dużą skalę, takich jak komórki, zaprojektowanego przez biologicznych...
