Spindela jest alternatywne podejście do identyfikacji biologicznym na długości rybosomalny RNA (rRNA), regiony genów. Generalnie, Przyrównanie sekwencji podstawowej genu rRNA z różnych gatunków zwierząt regiony przemiennego nukleotydów i zachowania zróżnicowania, zarówno pod względem podstawień nukleotydowych (zwanych powszechnie "SNP"), a insercja / delecja (Indel) zdarzeń. Obecność indeli powoduje sekwencji o różnych długościach i wprowadza różnic w ustawieniu, zazwyczaj oznaczone przez myślnik "-".
Nasze pojęcie identyfikacji biologicznej używa sekwencji genu rRNA w następujący sposób: konserwowane regiony w celu określenia zmiennych segmentów ("Spindela hiperzmienne regiony"), w których połączenie długości sekwencji jest charakterystyczne dla każdego gatunku ("profilu Spindela"). Tak więc, każdy gatunek może być określona przez unikatowy profil liczbowej.
W teorii, badanie zaledwie 6 z 20 regionów nadzmiennymi alleli każdego (lub 11 regionów z 5 alleli każdy) wystarczy dyskryminuje wszystkich gatunków eukariotycznych na Ziemi, których liczbę szacuje się od 5 do 15 mln liczby. W praktyce Spindela jest w stanie rozróżniać 93,3% gatunków eukariotycznych zmienności wewnątrzgatunkowej z niskiej i wysokiej rozdzielczości filogenetycznego.
Komentarze nie znaleziono