SeedWaterSegmenter

SeedWaterSegmenter to graficzne narzędzie Python interaktywnie segmentu stosy obrazów komórek w tkance z krawędzi-etykiet & nbsp (aka białe kontury.);. Interakcje są w całości oparte na edycji z nasion, które z kolei są rozszerzonej przez zlewni algorytmem. Główna różnica pomiędzy SWS i innych narzędzi jest to, że można umieścić więcej niż jeden materiał siewny na komórkę, które mogą pomóc dostosowania granic trudnych komórek.
SWS jest zbudowany na wxPython, matplotlib, numpy, scipy i mahotas.
W jego centrum, używa algorytmu przełomowym błyskawicznie (dzięki projektowi mahotas) i umożliwia aktualizacje w czasie rzeczywistym. Posiada prosty (jeśli bałagan) interfejs użytkownika i jest w pełni interaktywny, nawet w tym 1-undo.
Publikacja o SWS, który daje te wszystkie szczegóły i więcej cytometrycznie części A:
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cyto.a.22034/abstract
Kod źródłowy jest dublowany do czterech repozytoriów i PyPI:
- GitHub: http://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/
- Bitbucket: http://bitbucket.org/davidmashburn/seedwatersegmenter
- Gitorious: http://gitorious.org/seedwatersegmenter
- Google Code: http://code.google.com/p/seedwater/
- PyPI: http://pypi.python.org/pypi/SeedWaterSegmenter
Strona Google Code ma także kilka binarne (http://code.google.com/p/seedwater/), które powinny działać na 32-bitowym systemie Windows lub 64-bitowego systemu Linux, ale są to już stare. Proszę użyć "easy_install" metody teraz.
Aby uzyskać więcej informacji, zobacz Python Instrukcje instalacji 20XX.txt Można też czytać instrukcji: SeedWater Segmenter V xx manual.txt
Instalowanie i uruchamianie
Instalacja jest WRESZCIE proste!
W rzeczywistości, można teraz "easy_install SeedWaterSegmenter"
Szybkie wskazówki:
Windows / Mac:
& Nbsp; Instalacja Enthought Pythona Dystrybucja http://www.enthought.com/products/edudownload.php
Ubuntu / Debiana:
& Nbsp; sudo apt-get install python-setuptools python-wxtools python python-numpy-python-matplotlib scipy python python-obrazowania python-xlwt xlrd
W cmd okna (należy uruchomić jako administrator w Windows Vista / 7) lub Terminal (Mac / Linux), uruchom:
& nbsp; easy_install mahotas cmpGen EllipseFitter FilenameSort GifTiffLoader ImageContour SeedWaterSegmenter
Szczegółowe instrukcje:
Najnowsza wersja nazywa się:
"Python instrukcje instalacji 2012.txt sierpnia"
https://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/blob/master/Python instrukcje instalacji 2012.txt sierpnia

Wymagania :

< li> Python