NeuronVisio

Screenshot Software:
NeuronVisio
Szczegóły programowe:
Wersja: 0.8.6
Filmu: 20 Feb 15
Wywoływacz: Michele Mattioni
Licencja: Wolny
Popularność: 96

Rating: 5.0/5 (Total Votes: 1)

NeuronVisio łączy się z NEURON za pomocą nowego interfejsu Python NEURON.
Instalacja:
Aby zainstalować NeuronVisio musisz spełniać następujące zależności
& Nbsp; * pygtk
& Nbsp; * wizualne
& Nbsp; * matplotlib
Easy Install
Najłatwiej dostać neuronvisio jest, jeśli masz zainstalowany setuptools:
easy_install neuronvisio
Bez setuptools, to jeszcze dość łatwe. Pobierz plik neuronvisio.tgz z Cheeseshop stronie neuronvisio za, rozpakuj go i wykonaj:
python setup.py install
Dokumentacja
Dokumentacja jest dostępna w folderze doc lub Internecie.
Szybki
Ten kod jest po prostu dać pomysł w jaki sposób korzystać z modułu nrnvisio:
1. Uruchamiamy konsolę ipython z przełącznikiem pylab .:
& Nbsp; ipython -pylab # Jeśli nie użyć przełącznika nie będzie widać żadnych wykres.
2. Importowanie modułu:
& Nbsp; z neuronvisio.controls kontroli przywozu
& nbsp; Kontrola = Sterowanie ()
Gdy nrnvisio rozpoczęciem wątek jest uruchomiony. W tym wątku wszystkim proces nrnvisio nastąpi bez blokowania konsoli.
Jako szybki przykład następujący kod:
& Nbsp; 1. Tworzy jedną sekcję o nazwie Soma
& Nbsp; 2. Włóż kanał Hodgkey-Huxley i pasywnego przewodnictwo
& Nbsp; 3. Wstaw alphaSynapse do świadczenia STIMUL.
Szybkie przykładem może być po ::
z kontroli nrnvisio.controls przywozowych
Kontrola = Sterowanie () # Uruchomienie GUI
z neuron importu h # Pierwsze HocInterpreter
soma = h.Section () # Tworzenie sekcji
soma.insert ("hh") # Wstawianie kanał GG
soma.insert ("pas") # wstawienie pasywny przewodnictwo
syn = h.AlphaSynapse (0,5 s = soma) Wejście # synaptycznych
syn.onset = 0,5 # moment uruchomienia
syn.gmax = 0,05 # przewodność synapsy
syn.e = 0 # potencjalne odwrócenie
Więcej przykładów w show przykładem katalogu jak wykorzystać Neuronvisio z bardziej złożonego modelu

Opis .

  • wizualizacja 3D modelu z możliwością zmiany jej runtime
  • Tworzenie wektorów nagrywać żadnych zmiennych występujących w sekcji
  • Integracja Pylab do działki bezpośrednio na wynik symulacji
  • Eksploracja timecourse jakiejkolwiek zmiennej między czasie za pomocą kolorów zakodowany skalę
  • GUI działa we własnym wątku, więc jest to możliwe, aby korzystać z konsoli (wysoce zalecane ipython)

Wymagania :

  • Python

Podobne oprogramowanie

Antiprism
Antiprism

20 Feb 15

PyEphem
PyEphem

15 Apr 15

ctioga2
ctioga2

11 Apr 16

OpenVRML
OpenVRML

14 Apr 15

Komentarze do NeuronVisio

Komentarze nie znaleziono
Dodaj komentarz
Włącz zdjęć!