InterMine

InterMine dostarcza metod dostępu do datawarehouses zasilanych technologii InterMine.
InterMine jest potężnym open source systemu hurtowni danych. Korzystanie InterMine, można utworzyć baz danych dostępnych przez biologicznych zaawansowanych narzędzi kwerendy internetowej. Parsery są do integracji danych z kilku popularnych formatów biologicznych i nie ma ramy do dodawania własnych danych. InterMine obejmuje atrakcyjny, przyjazny dla użytkownika interfejs WWW, który działa "out of the box" i mogą być łatwo dostosowane do konkretnych potrzeb.
Cały kod InterMine jest dostępny bezpłatnie na licencji LGPL

Co nowego w tym wydaniu:.

• Łączenie się z InterMine:
• Istnieje kilka nowych sposobów, aby link do kopalni. Zobacz linki do informacji.
• formatów JSON usługi sieci Web:
• Istnieje kilka nowych formatów WebService wyniki. Dołączenie jsonobjects które pojawiły się w 0,95, teraz mamy formatów JSON za niemal wszystko:
• Wyniki:
• jsonrows - tabelaryczne przedstawienie danych z dodatkowych meta-danych
• & quot; jsontable & quot; . - Format kontenera na budowę wbudowanych szablonów (patrz: imbedding samouczek)
• & quot; Ilość & quot; i & quot; jsoncount & quot; - Formaty prostu otrzymaniu liczyć się z zapytaniem,
• WebService metadane (modeli i szablonów):
• & quot; json & quot; - Łatwo parsable wersje modelu danych i listy dostępnych szablonów
• Uwierzytelnianie Teraz Praca w Perl usługa Klienta:
• Użytkownicy klienta Perl usługa mają teraz dostęp programistyczny do swoich listach i prywatnych szablonów. Wystarczy podać swoje dane logowania do klienta, aby uzyskać dostęp do konta (Twoje dane są przekazywane w postaci zaszyfrowanej). Funkcja ta będzie działać we wszystkich kopalniach z serwisów internetowych, nie tylko tych na 0,96 i powyżej.
• Object Wyniki z Zestawienie Klientów:
• Klienci Perl i Java są w stanie uzyskać wyniki z powrotem jako obiekty (JSON obiektów, lub w Perlu, napompowane do pełnych obiektów wynikowych). Upraszcza to jakieś skomplikowane kwestie przetwarzania danych, oraz radzenia sobie z sprzężenia zewnętrzne i kolekcje.
• Stoły wbudowane:
• Możesz teraz natywnie osadzać tabel danych z każdej kopalni z usługa podtrzymujący do stron internetowych z JavaScript i CSS. Zobacz tutorial osadzenie na demonstrację i wprowadzenie do tej techniki. Pamiętaj, aby bawić się z nową biblioteką JavaScript dostępne w http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Rejestr:
• Uruchomiliśmy usługi centralnej rejestracji dla wdrożeń InterMine. To nie będzie służyć tylko jako & quot; żółto-stron & quot ;, umożliwienie odwiedzających do odkrywania nowych danych-sources, oraz ułatwienie współdziałanie pomiędzy samymi kopalń, ale również obsługuje usługi internetowe, zapewniając rejestru adresów WebService i wersjach. Odwiedź rejestr na http://www.intermine.org/registry, a za pomoc w rejestracji własnej kopalni, odwiedź RegisteringYourMine.
• link przekierowania:
• Możesz dodać obiekt do posiadania linki w wynikach strony przekierowują do dowolnego adresu URL. Zobacz LinkRedirects aby uzyskać więcej informacji.

Zawartość strony
• Strona główna:
• Strona domowa dla InterMine może być skonfigurowany do wyświetlania różnych informacji na podstawie tego, czy użytkownik jest nowy. Zobacz HomepageConfig instrukcje, jak skonfigurować ten problem.
• Nowy tag:
• Dodaliśmy nowy tag: im: admin. Jeśli tag szablon z im: admin, to nie pojawi się w webapp. Jest to przydatne do ukrywania szablony potrzebnych serwisów internetowych InterMine jest od swoich użytkowników. Zobacz Oznaczanie o listę wszystkich dostępnych tagów.
• przesyłać listy:
• Lista proces przesyłania została poprawiona.
• Inne zmiany:
• UPDATE - bardziej rygorystyczne korekty na wielokrotne testowanie hipotez wzbogacania widżetów. & Quot; Liczba testów & quot; Obecnie liczba terminów związanych z listy referencyjnej.
• AKTUALIZACJA - więcej osób opcje filtrowania na wzbogacania widgetów
• NOWOŚĆ - Holm-Bonferroni opcja dodawana do wzbogacania widgetów
• AKTUALIZACJA - nowej & quot; usuwać & quot; Przycisk na stronie list
• UPDATE - interakcje się na ekranie ładowane za pośrednictwem AJAX, informuje strona ładuje się szybciej,
• FIX - & quot; wynik & quot; Obrazy wyświetlane poprawnie, w wynikach wyszukiwania,
• AKTUALIZACJA - QueryBuilder bardziej interaktywne, wybierając pozycję na liście zabierze Cię z powrotem do pierwotnej pozycji po stronie odświeżania / reload
• AKTUALIZACJA - Link dodany do podsumowania kolumny w wynikach zapytania, podejmowanie łatwiej przeglądać różne wartości,
• FIX - logowanie błędów dotyczących mieszane nazwy użytkowników przypadków
• FIX - podczas oglądania po wyeksportowaniu danych widget widget błąd
• NOWOŚĆ - pytania szablonu są sortowane według popularności, jeśli nie jesteś zalogowany, w którym to przypadku są sortowane według daty ostatniego każde zapytanie prowadzony
• FIX - dane nie powtórzy się w & quot; różnego typu & quot; Sekcja na stronach raportu,
• FIX - szablony prawidłowo wyświetlane na stronie raportu nawet dla podklasy
• FIX - szablony poprawnie renderowania na stronach proporcji
• AKTUALIZACJA - aktualizacja BioGRID konwerter do obsługi zmian w najnowszych plikach danych
• FIX - różne & quot; Złoty & quot; CSS temat i zdjęcia poprawione i zaktualizowane,
• FIX - wątek kwestia bezpieczeństwa uwzględnione w szablonie śledzenia
• AKTUALIZACJA - widgety tabela może grupa przez atrybut, jak również klasy

Wymagania :

• Python