Gephi

Gephi to narzędzie do importowania, zwiedzanie, manipulować, analizować, filtr, clusterize, spatialise i eksport dużych wykresy i sieci

Co nowego w tym wydaniu:.

• Ten nacisk zwalniający na nowych funkcji zarówno dla użytkowników jak i deweloperów, oraz nowej licencji otwiera możliwości dla biznesu. Podgląd rankingu i moduły zostały całkowicie przerobione w sposób modułowy i można teraz rozszerzyć o wtyczek! Podgląd może być obecnie rozszerzony na wiele sposobów, na kształty krawędzi grupy instancji lub pakietowej. Ponadto ciągłe postępy zostały dokonane na dynamicznym obsługą sieci i zwolnić dziś ostatnią wielką rolę: statystyki w czasie, dostępne w module Statystyki gdy sieć jest dynamiczna. Dzięki użytkownikom, którzy zgłosili błędy, to jedyny sposób, aby je naprawić.

Co nowego w wersji 0.7 Beta:

• Nowe funkcje:
• Nowe dane laboratoryjne (Manipulowanie kolumny, Znajdź / Zamień, Merge, Sparklines ...)
• wizualizacja podłużny sieci topologii zmienia się w czasie, a także atrybuty
• Oś czasu jest teraz działa prawidłowo, pojawi się automatycznie, gdy wykres jest dynamiczny, jeden przycisk, aby włączyć filtrowanie
• Pokaż / Ukryj etykiety z filtrami - można zresetować "reset" efekt (widocznej po lewej stronie okna wykresu)
• Wyświetlacz wagi krawędzi jako etykiety na wizualizacji
• Nowy StAX GEXF importer i eksporter, z hierarchii i dynamiczne wsparcie
• Nowa lista / Tablice atrybutów typów. Mogą być przywożone jedynie z GEXF teraz.
• NIE Operator (Filtry)
• MASKA Operator (Filtry) - utrzymać krawędzie zgodnie źródło / cel / oba / dowolna - mogą łatwo uzyskać sąsiadów zestaw węzłów
• zrównywanie Filter - zrównywanie hierarchiczną wykres widzialnego widzenia transformacji meta-krawędzie w normalne krawędzi
• Filtr Nowy Giant Element
• Czas import Rama, nowa opcja "Importuj Raportu" importować kolejne pliki statyczne i przekształcić dynamiki
• W Suwak powiększenia opcji wizualizacji
• Opcja "przywóz brakujące węzły" w raporcie importu - wybierz, czy chcesz utworzyć je, czy nie,
• Ustaw rozmiar dla działania "Reset Size", klikając prawym przyciskiem myszy na przycisk resetowania rozmiaru
• Pobierz kolumnę stopni od nieukierunkowana wykresów
• Statystyki raporty zapisywane w projektach Gephi
• Nowa opcja "Waga" w przeskalować podglądu, aby wymusić na wadze wygląda tak samo jak Przegląd
• "oryginał" Nowa opcja na krawędzi kolor w podglądzie, zachowuje oryginalny kolor krawędzi, pochodzących z partycji na przykład
• Skopiuj i przenieść węzłów do nowego lub istniejącego obszaru roboczego
• Nowe presety Podgląd
• Lokalizacja jest obecnie możliwe, a zmiana języka z Gephi
• Po równoległe krawędzie zostały znalezione w czasie importu, teraz zwiększa wagę krawędzi domyślnie
• Opcja w Ego Filtr obejmuje węzeł nadrzędny, czy nie
• Meta-krawędzie mają teraz oddzielny suwak skalę w ustawieniach wizualizacji, zmienić, jak grube są one w porównaniu do normalnych krawędzi
• ranking i partycji lista atrybutów są obecnie klasyfikowane
• Ranking teraz aktualizuje się z filtrowanych wykresów. Kliknięcie na Zastosuj odświeży granic i przekształcenia (kolor, wielkość) jest prawidłowa,
• Teraz można przeciągnąć filtr sub kwerendy, aby stać się głównym zapytanie
• Z dynamiczne atrybuty, ranking, podziału, Wizualizacja i Filtry będą korzystać z obecnego zakresu osi czasu do znalezienia wartości
• waga krawędzi może być dynamiczny, typ DYNAMIC_FLOAT. Układ sił Atlas będzie korzystać z ofertą Timeline
• Filtry są odświeżane, gdy wykres jest modyfikowana, obecny filtr reexecuted
• Lokalizacja jest obecnie możliwe, francuski i hiszpański będą wkrótce dostępne
• Poprawki błędów:
• Źle krawędź usunięty z filtrem krawędzi Waga (błąd 603469)
• Filtrowanie wyświetlane kadłubów wypukłe (błąd 541819)
• NullPointerException podczas filtrowania nieukierunkowana (błąd 571153 grafy)
• NullPointerException na importowanie dynamiczny wykres (błąd 581872)
• Problem suwak GTK + (błąd 529913)
• Meta-krawędzie nie są wyświetlane (błąd 584283)
• Nie jest wyświetlanie podglądu meta-krawędzie (błąd 584289)
• Błędy z Yifan Hu wielopoziomowego układu na wykresie filtrowane (błąd 594643)
• Tryb Węzeł Rozmiar i filtru paramaters nie zapisać w projekt (błąd 596430)
• wyciek pamięci w GEXF / GraphML (błąd 596872 Parser)
• Nieprawidłowa masa wzajemne krawędzi na podglądzie (błąd 610469)
• Postęp nie jest wyświetlany podczas otwierania / zapisywania projektu (błąd 594644)
• Nie można anulować otwarcie projektu (błąd 616415)
• Powolność na zbieranie wpis partycji (błąd 519549)
• Konfiguracja EdgeList baz danych nie jest zapisane (błąd 571263)
• 'start' i atrybuty 'końca' brakuje podczas eksportowania dynamiczny GEXF (błąd 521848)
• Partition & quot; All Blacks & quot; Funkcja losuje kolory (błąd 601066)
• Nie filtrowane wykres eksportowane z & quot; Wybierz & quot; wciśnięty (błąd 573685)
• Ustawienia filtra nie partycji zapisanych na przełączaniu pulpitów (błąd 616052)
• Otwarcie zarchiwizowanych plików ZIP jest uszkodzony (błąd 578876)
• Wyjątek na kliknięcie na "hierarchii" podczas pracy układu wielopoziomowego (błąd 631663)

Dane
• importer GraphML nie importuje etykiety węzłów (błąd 581629)
• Nie można zapisać / zapisuje, jak podczas otwierania Gephi DoubleClick wykres w systemie Windows (błąd 583397)
• ForceAtlas i Fruchterman Reingold nie layouting z meta-bug 584286 krawędzi ()
• wyciek pamięci w Graph (błąd 587450 Odległość)
• NullPointerException podczas wykonywania & quot; wektor własny centrality & quot; Statystyka (błąd 589731)
• NullPointerException podczas przełączania się między obszarami roboczymi, podczas gdy układ działa (błąd 597458)
• Nie można przeciągnąć filtr sub-zapytanie stać zapytanie błąd 626495 głównego ()
• parametry rankingowe ponownie zainicjowany w każdym nowym rankingu (błąd 594231)
• Ranking odświeżane, gdy wykres nie filtrowane (błąd 632459)
• Węzeł niewidoczne (zbyt mała), gdy tworzony z ołówkiem węzłów (błąd 574807)
• Błąd podczas otwierania Plugin Center (błąd 616829)
• Nie można wybrać w ustawieniach sterownika PostgreSQL importu bazy danych (błąd 595223)
• Nie można wyświetlić wagi krawędzi jako tekst (błąd 603134)
• Importuj przekształcić się nieukierunkowana nie połączyć masy (błąd 603478)
• Kliknij prawym przyciskiem myszy na obszarze roboczym po usunięciu węzła rzuca & quot; węzeł nie może być null & quot; (Błąd 605947)
• In / Out stopień metryka nie działa z nieukierunkowana (błąd 606305 wykresów)
• NullPointerException przy wyborze & quot; - Wybierz układ & quot; w ComboBox Layout (błąd 606964)
• Workspace Wybór nie odświeżyć po zamknięciu (błąd 616814 obszaru roboczego)
• Wybór Wizualizacja kolor inwersji pomiędzy "na zewnątrz" i "zarówno" koloru (błąd 618726)
• "Format" nie jest rozpoznawany na import (błąd 619069 DL)
• Nie ukryte okno Edytuj w zakładkach (błąd 552494)
• Dynamiczny wykres nierozpoznany jeśli wieczne węzłów (błąd 555637)
• FileNotFoundException podczas oszczędności pliku PDF (błąd 572876)
• & quot; Węzeł musi być na wykresie & quot; Błąd podczas importowania hierarchiczną wykres z wysokości większej niż 1 (błąd 577180)
• Auto skalę odwraca wykres (błąd 577843)
• Nie da się anulować Średnia długość drogi obliczenia Statystyczny (błąd 590226)
• Wskaźnik Podgląd niedostępny raz pierwszy (błąd 594176)
• Domyślny wybór węzłów w Laboratorium danych konieczne (błąd 594515)
• & quot; CommandLineParsing zerowy & quot; Komunikat o błędzie podczas otwierania, gdy plik z linii poleceń lub pulpitu (błąd 594630)
• Nie można zaimportować ten sam plik dwukrotnie w oknie powitalnym (błąd 598157)

Problem eksportu
• plik CSV (błąd 598767)
• Nie można zamknąć projekt podczas generowania wykresu (błąd 631341)
• Wizualizacja ograniczenie rozmiaru (błąd 602470)
• W oknie duplikat etykiety (błąd 604003 filtra)
• Nie partycji podczas otwierania projektu odświeżanie nie z błędów 612902 (Przegląd)
• współrzędna nie eksportowane (błąd 614606 GraphML)
• Nieprawidłowe ustawienie położenia węzłów, gdy X lub Y do zera (błąd 615844)
• Wybrany filtr nieprawidłowo zapytania odświeżane w UI (błąd 626483)
• Eksport do PDF tle jest zawsze biały (błąd 583386)
• pliki SVG nie wymienione w oknie dialogowym Export (błąd 626394)
• Niewłaściwy rozmiar węzła, gdy Ranking ma taki sam rozmiar min i max (błąd 631689)
• Przeczytaj pozycje z plików (błąd 594793 dot)
• Ranking i parametry działowe nie sortowania listy (błąd 594520)
• Nie Stopień węzła w Label Ustawienia tekstu (błąd 598170)
• Źle folderu wybranego w panelu Export przy zmianie typu pliku (błąd 620337)
• Tworzenie wykresu na poprzednio załadowany niekierowanego wykresie (błąd 624671)
• Źle masa udaru, gdy SVG przywiezione Illustrator (błąd 626378)
• Filtrowanie nie odświeżany, gdy pod-zapytań wymienione lub usunięte (błąd 594511)
• Błędy na eksport PDF, gdy etykiety mają rozmiar czcionki zera (błąd 626865)
• Tekst wyświetlany w podglądzie nie bug 627567) (
• Krawędzie rodzimych kolorów nie są wyświetlane w podglądzie (błąd 586237)
• Wagi Edge to różnie wykresie i Preview (błąd 569329)
• Negatywne krawędzie nie świadczonych w podglądzie (błąd 628223)
• Krawędzie waga nie połączyła się z równoległych krawędzi (błąd 648600)
• Filtr podziału automatycznie filtruje wartość null (błąd 648600)
• Wyjątek na pliku projektu (błąd 648617 otwarcia)
• Ego Filtr nie obejmuje samego węzła (błąd 649908)
• Eksport PDF tylko z domyślnej czcionki (błąd 651273)
• Węzły nie odznaczone po wyłączeniu Wybór Panel (błąd 649920 Filter)
• API:
• Dodaj metodę Spłaszczenie () do HierarchicalGraph spłaszczyć hierarchiczną wykres i przekształcić w regularne krawędzie meta krawędzi.
• Dodaj zniszczyć (filtr Filter) w FilterBuilder aby otrzymać powiadomienie, gdy kwerenda filtr jest usuwany i oczyszczenia.
• Dodaj MetaEdgeBuilder w Graph SPI, aby umożliwić niestandardowych budowniczych. Dodaj GraphSettings.setMetaEdgeBuilder () w ustawieniach modelu wykres.
• Modyfikuj StatisticsModel przechowywać raporty bezpośrednio zamiast instancji statystyk. W konsekwencji, model ma teraz getReport () i metodę getResult (UI), które można użyć. Statystyki aktualnie uruchomione mogą być teraz uzyskać z metodą nowy getRunning ().
• Uproszczenie i usprawnienie zarządzania wydarzeń atrybutów. Detektory zdarzeń teraz zapisać się bezpośrednio z AttributeModel zamiast AttributeTable i otrzyma imprezy dla wszystkich tabel. Refaktoring klasy AttributeEvent z AttributeTable jako źródła i nowego obiektu AttributeEventData jako dane. Nowy SET_VALUE został wdrożony do uzyskania zdarzenia, gdy wartości atrybutów są ustawione.
• Zmiany w AttributeRowFactory metoda newNodeRow () przyjmuje teraz obiekt właściciela NodeData jako parametr. Podobnie dla newEdgeRow () i newRowForTable ().
• Dodaj getEdge (węzeł, node) w GraphAPI dla zachowania spójności.
• Zmiany w procesor SPI. Procesor ma teraz ustawiaczy zamiast metody proces () z parametrami. Jak procesory są utworzone pozostaje taka sama. Utworzenie interfejsu ProcessorUI procesory do konfiguracji ustawień. Realizacja ProcessorUI zapewnia panel, który jest wyświetlany po zamknięciu raportu importu. ProcessorUI pozwala również wyłączyć procesor z pewnymi warunkami.
• Dodaj GetColor () metoda w NodeDraft i EdgeDraft.
• Zdefiniuj & quot; Przegląd, & quot; Laboratorium danych & quot; i & quot; Podgląd & quot; jako perspektyw. Tworzenie nowego SPI dla perspecives i członków perspektywy. Członkowie są po prostu TopComponent które należą do perspektywy. Wtyczki mogą wdrożyć PerspectiveMember aby zdefiniować zachowanie otwierania i zamykania.
• Dodaj rodzaje / Lista tablicy w atrybutach API. Wszystkie rodzime typy ma teraz powiązany typ listy, z wyjątkiem dynamicznych typów. Rodzaje lista dziedziczy AbstractList.
• Zmiany w sposobie transakcji importu API z przedziałów czasowych i danych dynamicznych. Wsparcie dla dynamicznych atrybutów został dodany z metodą nowy addAttributeValue () w NodeDraft i EdgeDraft. Dla zwiększenia możliwości porządkowania danych, NodeDraftGetter i EdgeDraftgetter teraz zwraca AttributeRow zamiast listy tylko wartości atrybutów. Wreszcie, aby korzystać z najnowszych ulepszeń, projekty zwraca się bezpośrednio do elementów TimeInterval typu zamiast listy plasterki. Metody z "plaster" została zmieniona na "Interval" dla zachowania spójności.
• Dodaj dynamiczne typy w Atrybuty API. Dynamiczne typy wartości Sklep z przedziału czasu i zapytania można dostosować za pomocą estymatorów. Wszystkie rodzaje dynamicznych dziedziczyć DynamicType
• poprawa zarządzania zdarzeniami Graph API. GraphEvent teraz ma dokładnych zdarzeń, w tym ADD_NODES, REMOVE_NODES, ADD_EDGES, REMOVE_EDGES i VISIBLE_VIEW. Nowy interfejs GraphEventData został stworzony, aby pobrać elementy związane z wydarzeniami.
• Export API refaktoryzacji, inspirowany z ImportAPI. Tworzenie interfejsu ExporterBuilder do tworzenia eksportera i różnych eksporterów: GraphExporter, VectorExporter, ByteExporter i CharacterExporter która obejmuje wspólne sprawy. Sposób eksporterzy zapisu danych został zracjonalizować używając zarówno java.io.Writer (tekst) lub (bajt) java.io.OutputStream. ExportController został ulepszony w celu wspierania wszystkich przypadków użycia, w tym pliku, pisarz i eksportu strumienia.
• Dodaj czopa wsparcie dla ImportAPI i SPI. Jak DatabaseImporter, interfejs SpigotImporter jest nowy typ importerów. Modyfikacje mają być wykonane do ImportController wspierać czop importu.
• Refaktoryzacja i ulepszenia w interfejsie API import i SPI. Celem refaktoryzacji jest rozwiązać problem z singleton importerów i pozwolić użytkownikom realizować budowniczych interfejs tworzenia instancji importerów. Dlatego interfejs ImporterBuilder została stworzona i powinny być rejestrowane z dopiskiemServiceProvider. Rodzaje różne importerów zostały uproszczone i pozostawić większy wybór do wdrożeń o tym, jak wejście jest zarządzany. Importerzy XML i plików Tekst została połączona w interfejsie FileImporter, pracy z java.io.Reader. Użyteczności metody statyczne, na przykład uzyskać dokument z Reader można teraz znaleźć w nowej klasie ImportUtils. ImportController została uproszczona do importu pliku, a teraz przyjmuje java.io.Reader również. Głównym ulepszeniem tych modułów w poparciu dla elementów interfejsu importerów. Celem jest umożliwienie importerzy zdefiniować realizacji ImporterUI zarządzania ustawień tych importerów.
• poprawa zarządzania identyfikatorów GraphAPI. System jest teraz przechowywania identyfikatorów String pochodzących od użytkowników. Nowe pozyskiwaniu i metody ustawiaczy zostały utworzone na wykresie: Graph.setId (String), węzeł, Graph.setId (Edge, String), Graph.getNode (String), Graph.getEdge (String). W NodeData.setId () i EdgeData.setId () metody zostały usunięte, zgodność nie może być dotrzymany. Fabrycznie ma również zostać zmieniony, aby umożliwić tworzyć elementy z ID String bezpośrednio, ponieważ nie jest już możliwe, aby zrobić z NodeData.
• Zmiany w AttributesAPI z zarządzania zdarzeniami. System wyszukiwania w AttributeTable został zastąpiony przez bardziej tradycyjnego systemu zarządzania zdarzeniami, z nowymi interfejsami AttributeEvent i AttributeListener. Realizacja wysyłki jest teraz w osobnym wątku.
• Zmiany w Importuj do oddzielnych modułów podstawowych i interfejsów użytkownika. ImportController teraz robi zadanie import tylko i nowy ImportControllerUI jest wyświetlanie interfejsu użytkownika (Zgłoś panelu). Interfejs ImportControllerUI znajduje się w module DesktopProject i powinny być odpowiednio użytkownikowi importowanie pliku z wtyczki. Metody ImportController może być używany z zestawu narzędzi.

Co nowego w wersji 0.7 Alpha 4:

• zwolnienie a4 został właśnie wydany, i przyjść w zestaw nowych funkcji i wielu bufixes. W kolejnej wersji beta i powinny być wyposażone w większą stabilność i stałym zestawem funkcji.

Co nowego w wersji 0.7 Alpha 3:

• Więcej niż 25 błędy zostały poprawione w tej wersji , a niektóre drobne elementy dodane. Wersja dodaje również & quot; Gephi 3rd Party & quot; Wtyczka źródło w centrum Plugins. Katalog jest obecnie odczytywane z obu oficjalnych partyjnych i 3. źródeł. Dwa nowe moduły, które zostały dodane.

Co nowego w wersji 0.7 Alpha 2:

• Nowe funkcje:
• Wsparcie waga Lepsze krawędź. Waga nie jest już modyfikowany przez & quot; Auto-skali & quot; Opcja na import.
• Lepsze węzły / krawędzie liczenia. Liczy się tylko widoczne węzły.
• Pomóż ustawień Statystyki / Metrics panele. Dodaj opis i dokumentację na temat wskaźników i ich ustawienia.
• Projekt zapisu / odczytu został skorygowany. Należy pamiętać, że zgodność z 0.7alpha1 jest uszkodzony.
• mechanizm automatycznej aktualizacji Fix. Kolejne aktualizacje będą dostępne poprzez wbudowany w aktualizacji oprogramowania.
• Poprawki błędów:
• zamrożenie aplikacji podczas importowania plików w systemie Linux (błąd 519423)
• Okno Układ nie może być przywrócony, gdy został oddokowane (błąd 519424)
• Anner niewidoczne w systemie Mac OS X i Linux (błąd 522403)
• Podgląd nie ukrywa odfiltrowane elementy (błąd 522402)
• load projektu / zapisać interfejs nie (błąd 522889)
• puste etykiety węzła powoduje błędny komunikat o błędzie podczas importu & quot; unkown ID węzła & quot; (Błąd 519254)
• W eksporcie GDF, usuwając kolumny nie usuwa przecinek (błąd 519810)
• W eksporcie GDF pole Id jest źle uciekł (błąd 519820)
• Kryteria filtrowania krawędzi (błąd 522771 wybryków)
• Kontekst danych nie działa na nieukierunkowana Graph (błąd 522886)

Wyświetlacze
• Filtr Dynamiczny 0 węzeł (błąd 523128)

Tag
• Opcje działa tylko na jedną literę wartości (błąd 519252)
• Ulubione, właściwości i menu pojawi się w wyjściowym oknie i nie mogą być zamknięte. (Błąd 521400)
• lepsze występy podczas regulacji zakresu za pomocą myszki (błąd 521939)
• naprawiono błąd w kontaktach z dynamicznych typów danych innych tego dnia (błąd 521544)
• naprawiono błąd z wizualnym repartycji podziałką (błąd 521941)
• Użyteczność:
• Node i przycisk przełączania krawędzi w VizBar mają ten sam tekst podpowiedzi
• Zgłoś panel (Import) jest pionowo rozszerzalny
• Aktualizacja modułów:
• DesktopContext
• DesktopBranding
• DesktopHierarchy
• DesktopPartition
• DesktopRanking
• DesktopTools
• VisualizationModule
• DesktopImport
• DesktopLayout
• ProcessorPlugin
• DHNSGraph
• DesktopTimeline
• TimelineAPI
• TimelinePluginUI
• ExportPlugin
• ImportPlugin
• StatisticsPluginUI
• GraphAPI
• ExportPluginUI
• PreviewImpl
• DesktopPreview
• FiltersPlugin
• ImportAPI
• DesktopFilters
• ProjectAPI

Co nowego w wersji 0.7 Alpha:

• Wersja alfa 0,7 Gephi został opublikowany i jest dostępny dla celów testowania. W 0.7 jest kompletnym przepisywanie, będzie musiała wersji alfa i beta do zamarł możliwości i naprawić wszystkie błędy.
• Wszystkie pozostałe 0,6 błędy zostaną usunięte teraz.
• dodatkowa uwaga na temat kodu źródłowego: Musisz zaktualizować Netbeans 6.8 z bieżących modułów aktualizacjach być zgodne z aktualnym repositiory
.

Co nowego w wersji 0.6 Beta 3:

• Błędy związane z 0,6 serie zostały oczyszczone. Byliśmy reorganizacji, aby było jasne dla 0,7 rozwoju.
• Faktem jest, że 0.7 jest zupełnie nowy w porównaniu do 0,6, więc błędy nie są powiązane i 0,6 rozwój został zatrzymany.
• W związku z tym jedyną rzeczą do zrobienia jest, aby czekać na 0.7 alpha nadchodzi.
• Nie trzeba dodawać raporty błędy nadal istnieje i że należy bardzo uważać, aby nie powtarzać tych samych błędów na 0,7.

Wymagania :

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment
• OpenGL