DOLFIN

To jest proste, spójne i intuicyjne obiektowego API w C ++ i Python

Opis .

• Automatyczne i skuteczna ocena skończonych form elementem wariacyjnych przez FFC lub SyFi
• Automatyczne i efektywny montaż systemów liniowych,
• Ogólne rodziny elementów skończonych, w tym dowolna kolejność elementów ciągłych i przerywanych, elementów skończonych Lagrange BDM, elementów RT, elementów BDFM, elementów Nédélec i Crouzeix-Raviart
• Elementy mieszane jak dowolnych kombinacji podstawowych elementów, w tym na przykład Taylor-Hood,
• metody Lamela Galerkina tym względem skoku, średnich i całek ponad aspektów siatki wnętrze
• Wysoka wydajność algebra liniowa przez uBLAS, PETSc, Trilinos i MTL4 (eksperymentalne) z prostego C ++ i Python owijarki,
• montaż równoległy i rozwiązać
• Simplex oczek w 1D, 2D (trójkąty) i 3D (czworościanów), w tym adaptacyjne wyrafinowanie oczek
• Wielu adaptacyjne mcg (q) / MDG (q) i mono-adaptacyjne cG (q) / dG (q) rozwiązują ODE
• Wsparcie dla wielu formatów wejścia / wyjścia, w tym Dolfin XML, VTK, Octave, MATLAB, Diffpack, Exodus II

Co nowego w tym wydaniu:

• Ta wersja przynosi wiele porządków i poprawek błędów względnych do nowo wydany Dolfin 1.0-beta2.

Co nowego w wersji 0.9.11:

• Zmiana licencji LGPL v2.1 się z LGPL v3 czy później,
• Przeniesiony meshconverter do dolfin_utils
• Dodaj wsparcie dla konwersji markerów siatek Gmsh materialnymi na
• Dodaj wsparcie dla źródeł punktowych (klasa PointSource)
• Zmień nazwę logowania - & # x3e; set_log_active
• Dodaj parametr & quot; clear_on_write & quot; do timeseries
• Dodaj poparcie dla wejścia / wyjścia z zagnieżdżonych zestawów parametrów
• Sprawdź wymiary w rozwiązują liniowych
• Dodaj wsparcie dla automatycznej kontroli błędów dla wariacyjnych problemów
• Dodaj wsparcie dla udoskonalenia MeshFunctions po wyrafinowanie oczek
• Zmień kolejność testów i próbnych przestrzeni w konstruktorów Forma

Co nowego w wersji 0.9.10:

• Dodaj wsparcie dla automatycznej kontroli błędów dla wariacyjnych problemów.
• Dodaj wsparcie dla udoskonalenia MeshFunctions po wyrafinowanie oczek.

Co nowego w wersji 0.9.9:

• Zmień budować system CMake
• Dodaj nazwie MeshFunctions: VertexFunction, EdgeFunction, FaceFunction, FacetFunction, CellFunction
• Pozwala na ustawienie stałych warunków brzegowych bez użycia Stała
• Pozwala na ustawienie warunków brzegowych w oparciu o ciąg (& quot; x [0] == 0.0 & quot;)
• Tworzenie brakujących katalogów, jeżeli został on określony jako część nazwy pliku
• Możliwość ponownego wykorzystania przygotowujące do większości backendów
• Poprawki dla UMFPACK solver na niektórych 32-bitowych,
• dostęp do większej liczby przygotowujące Hypre poprzez PETSc
• Aktualizacje dla SLEPc 3.1
• Pomóż i wdrożenie ponownego wykorzystania factorizations LU dla wszystkich backendów
• Naprawiono błąd w udoskonaleniu MeshFunctions

Co nowego w wersji 0.9.3:

• Dodaj globalny parametr & quot; ffc_representation & quot; reprezentację w postaci kompilatora JIT FFC
• normą function () obsługiwać zarówno wektory i funkcje w Pythonie,
• SpeedUp warunki brzegowe i dokonać okresowej pracy dla mieszanych (wektor-ceniony) elementów
• Dodaj możliwości korzystania z tablicy liczba Numpy podczas przypisywania macierze i wektory
• Dodaj możliwości korzystania z tablicy wskaźników dla liczb całkowitych numpy w macierzach i wektorach
• Fix int typemaps w PyDOLFIN
• Split mult w mult i transpmult
• Filtrowanie PETSc argumentu podczas analizowania parametrów wiersza polecenia,
• Rozszerz komentarzy łyk pliki interfejsu
• Dodaj do plików temat praw autorskich interfejsu łyk (nieukończone)
• Dodaj typemaps dla std :: vector misc & # x3c; typy i # x3e; w PyDOLFIN
• Usuń zależności od std_vector.i redukujących wielkość SWIG kodu otoki
• Użyj względnej% zawiera w dolfin.i
• Zmiana nazwy na plikach interfejsu łyk dolfin_foo.i - & # x3e; foo.i
• Dodaj () funkcji interpolować interfejsu Python
• typmaps Fix dla Pythona 2.6 w uint
• Użyj TypeError zamiast ValueError w typechecks w typmaps.i
• Dodaj / pomniejszyć shared_ptr & # x3c; Epetra_FEFoo & # x3e; typemaps dla PyDOLFIN
• kompilacja Fix JIT równolegle
• Dodaj funkcję compile_extension_module w PyDOLFIN
• Fix błąd w Pythonie przypisywania wektora
• Dodaj wsparcie dla sprężonego base64 zakodowane pliki VTK (przy użyciu zlib)
• Dodaj wsparcie dla plików zakodowanych w base64 VTK
• Eksperymentalne wsparcie dla montażu równoległego i rozwiązać
• Funkcja Bug fix w projekcie (), aktualizacja do składni UFL
• Usuń disp () funkcje i zastąpić informacją (bla, true);
• Dodaj testów jednostkowych fem (Python),
• Czyszczenie SystemAssembler
• Włącz assemble_system przez PyDOLFIN
• Dodaj "normę", aby GenericMatrix
• Usprawnienia w NewtonSolver
• Zmień nazwę NewtonSolver :: get_iteration (), aby NewtonSolver :: iteracji ()
• Poprawki do EpetraKrylovSolver :: rozwiązać
• Dodaj konstruktora Wektor :: Wektor (const GenericVector & x)
• Usuń ostrzeżenia amortyzacyjne SCons
• naprawić wyciek pamięci w PETScKrylovSolver
• Zmień nazwę dolfin_assert - & # x3e; dochodzenia i korzystać z wersji C ++
• Fix debug / optymalizacji flagi
• Usuń AvgMeshSize, InvMeshSize, InvFacetArea z SpecialFunctions
• Zmień nazwę MeshSize - & # x3e; CellSize
• System parametr Przepisz z ulepszone wsparcie dla wiersza polecenia parsowania,
• lokalizacja pozostałych parametrów (na klasy) i użyteczność z Pythona,
• Usuń OutflowFacet z SpecialFunctions
• Zmień nazwę interpolować (double *) - & # x3e; interpolate_vertex_values ​​(podwójne *)
• Dodaj Python wersja demo Cahna-Hilliard,
• Naprawiono błąd w assemble.py
• Zezwolenie funkcji interpolacji między oczkami nie pasujące
• Usuń Funkcja (Function :: std :: string filename)
• Przejście do nowego XML io
• Usuń GenericSparsityPattern :: sort
• Wymagaj klasyfikowane / nieposortowane parametrem SparsityPattern konstruktora
• Poprawa wydajności SparsityPattern :: insert
• Wymień stałe teksty z łańcuchami do algebry liniowej i wbudowanych oczek
• Możliwość bezpośredniego dostępu do wartości Constant
• Inicjalizacja podmiotów w konstruktorze MeshEntity automatycznie i sprawdzić zakres
• Dodaj testów jednostkowych do memorycheck
• Dodaj zadzwonić do czyszczenia libxml2 parser na wyjeździe,
• Usuń zbędnych argumentów funkcji członka DofMap
• Usuń konstruktorów referencyjnych z DofMap, FiniteElement i FunctionSpace
• Użyj shared_ptr do przechowywania siatki w obiektach DofMap
• Interfejs do zmiany kodu otoki: PoissonBilinearForm - & # x3e; Poissona :: BilinearForm
• Dodaj funkcję info_underline () do pisania podkreślone wiadomości
• Zmień nazwę wiadomość () - & # x3e; info () dla & quot; kompatybilności & quot; z modułem logowania Python
• Dodaj elementwise mnożenie interfejs GeneriVector
• Interfejs GenericVector w PyDOLFIN teraz obsługuje protokołu sekwencji
• Zmień nazwę z CamelCaps funkcje nazwy: foobar - & # x3e; foo_bar
• Dodaj krojenie możliwości dla interfejsu GenericMatrix w PyDOLFIN (tylko GetItem)
• Dodaj krojenie możliwości dla interfejsu GenericVector w PyDOLFIN
• Dodaj sumę do interfejsu GenericVector