Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere oferuje unikalne połączenie literatury-górnictwa i analizy ścieżki dla biologów molekularnych zainteresowanych regulacji genów i sieci biologicznych.
 BiblioSphere Ścieżka Edition korzysta z obszernej bazy danych indywidualnie modelowanych relacji między genów, białek, kompleksów, komórek i tkanek wraz z up-to-date tekstowych technik górniczych do automatycznej ekstrakcji wiedzy, aby umożliwić powiązanie danych do sieci biologicznych w różnych kontekstach biologicznych.
 Użyj BiblioSphere do

• rozszerzenia sieci biologicznych poza kanonicznej informacji szlaku (regulacyjne i metaboliczne)
• scalić wysokie wyniki przepustowości z wiedzy biologicznej i sekwencji analiz opartych
• wykonywanie kontekstowym Analiza ścieżki wrażliwe regulacyjne
• generować specyficzny eksperyment szlaku warianty
• Link ścieżek mechanizmów i genów chorobowych,
• Nie zaawansowany projekt eksperymentalny,

Co nowego w tym wydaniu:

Nowy i Ulepszony Źródła danych

• Genomatix Ekspert Curated Gene-Gene Relacje:
   Genomatix zintegrował swoją opatentowaną bazy wiedzy ekspertów kuratorem danych na temat regulacji genów do BiblioSphere. Ta unikalna źródła danych dodaje semantykę związków genu genowej generowane dynamicznie sieci genów BiblioSphere, dostarczając informacje, takie jak "Gene aktywuje transkrypcję genu B" lub "Gene fizycznie oddziaływuje z genu B".
  
• szlaki transdukcji sygnałów:
   Fragmenty Gene Ontologia istotnych dla transdukcji sygnału, jak również dane zebrane z literatury zostały połączone, aby umożliwić identyfikację kanonicznych ścieżek połączonych z siecią koncentruje.
  
• metabolizm Stowarzyszenia:
   Metaboliczne stowarzyszenia szlaku zostały zintegrowane, aby umożliwić identyfikację zdarzeń metabolicznych istotnych do zestawu genów.
  

• Ścieżka Zobacz relacje z ekspertów kuratorem gen-gen
   Grupy genów są kompilowane w łatwo zrozumiałej dynamicznych wykresów sieciowych łączących ręcznie kuratorem relacji gen-gen z danych pochodzących z automatycznej ekstrakcji wiedzy. Sieci mogą być dostosowywane przez filtry i koncentruje się na środku genu najkrótszej drodze do przeprowadzenia analizy ścieżki.
  
• Zobacz komórkowy Lokalizacja
   Na podstawie GO Adnotacje genów są przypisane do ich lokalizacji w obrębie komórki i wizualizowane jako diagramu układ komórek, co pozwala zidentyfikować obszary subkomórkowe i enklawy dotyczące zestawu genów.
  

• Zarządzanie projektami: Zarządzanie analiz poprzez organizowanie ich w folderach projektowych. Szybki dostęp do poprzednich wyników z kilku kliknięć myszką lub dodać nowe wyszukiwania do istniejących projektów.
  

• Rozszerzenia i różne drobne poprawki błędów,

Wymagania :

• Mac OS X 10.2 lub nowszy,
• Java 1.4.1 (aktualizacja 1 jest zalecany)
• podłączenie do internetu
• konto oceny Genomatix (bezpłatnie)