Arabidopsis Motif skanera (AMS) jest aplikacją Windows, który działa na komputerach lokalnych. Został on opracowany na budowę sieci genów poprzez określenie pozycji elementów cis-regulacyjne w modelu roślin Arabidopsis thaliana oraz poprzez zapewnienie łatwego interfejsu dokonywania oceny relacji genu. Jego główną cechą jest innowacyjny połączyć cis-regulacyjnych pozycji elementów, NGS i DNA Chip Matryce dane wyrażenie, adnotacje Arabidopsis i interakcje genów do identyfikacji sieci genów regulowanych przez czynniki transkrypcyjne. W badaniach koncentruje się na funkcji czynników transkrypcyjnych, oprogramowanie wykorzystuje dane wyrażenie i wiążące motywy miejscu w regionach genów regulujących przewidzieć bezpośrednie genów docelowych. Dodatkowo, AMS wykorzystuje DNA-białko i interakcji proteinprotein danych w celu ułatwienia identyfikacji szlaków metabolicznych regulowanych przez czynnik transkrypcyjny zainteresowania.
Komentarze nie znaleziono