KROKI jest pakiet dla dokładnej symulacji stochastycznych systemów reakcji dyfuzji w dowolnie złożonych geometrii 3D. Nasz algorytm symulacji rdzeń jest realizacja Gillespie SSA, przedłużony do czynienia z dyfuzją cząsteczek ponad elementami 3D...
NEO (Zespół neuronów Przedmioty) i jest to projekt, aby zapewnić wspólny zestaw klas bazowych do stosowania w neuronowej analizy danych, w celu uzyskania OpenElectrophy, NeuroTools i być może innych projektów o podobnych celach bardziej blisko siebie.Dwa...
OpenElectrophy to ramy dla ułatwienia manipulacji, przechowywania i analizy danych elektrofizjologicznych. To może importować dane z wielu różnych formatów plików i przechowywać je w jednej bazie danych typu SQL.Narzędzia analizy zawarte w OpenELectrophy...
TORF to pakiet programów do przechwytywania, przewidywania i analizy cech biofizycznych białek.Zobacz http://enzyme.ucd.ie/PEAT do dokumentacji, instrukcji, screeny itp Wymagania . ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) jest efektywny program, który wyrównuje relatywnie krótkich sekwencji nukleotydowych wobec długiej sekwencji referencyjnej, takich jak ludzki genom.Program realizuje dwa algorytmy, BWA-krótki i BWA-SW. Dawne prace dla...
SSuMMo jest biblioteka funkcji zaprojektowanych wokół iteracyjnie przy użyciu HMMER przypisać sekwencję do taksonów. & Nbsp; Wyniki są bardzo odnotowany tam drzewa z gatunku / dystrybucji w obrębie tej wspólnoty genus.Programy zawarte w kodzie źródłowym...
babka jest API Pythona do odczytu plików binarnych danych utworzone za pomocą ram zarządzania danymi Babka Next-Gen.Zazwyczaj ten katalog jest jako część całego pakietu babka, dostępny od:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Kompletny pakiet zawiera kod...
PySCeS to projekt przygotowany przez Triple J Group dla Molecular Cell Physiology. & Nbsp; w celu spróbować model i zrozumieć złożone procesy i systemy, które składają się na żywą komórkę Opis . tekstowy opis modelu języka strukturalne moduł...
Pysam jest moduł Pythona do odczytu i manipulowania Samfiles. & Nbsp; To lekki Owijka samtools C-API.Skrócona instrukcja jest tutaj. Szczegółowa dokumentacja dostępna jest tutaj.Pytania i komentarze są mile widziane i powinny być wysłane do grupy...
TRMiner to narzędzie Pythona, który ma na celu naukowe kuratorów danych. & Nbsp; Pozwala szybko przycinać duże zbiory publikacji naukowych kar odpowiednich dla danego celu górniczego.Osiąga się to w dwóch etapach. Po pierwsze, teksty są tranlated w ciągi...
