NetAtlas jest plugin Cytoscape danych, która wykorzystuje tkanki ekspresji genu do filtrowania sieci komórkowej sygnalizacji. NetAtlas identyfikuje sieci tkanki zdefiniowane, elementów sieciowych specyficznych dla tkanki, i składników o skorelowanych...
CLC Sequence Viewer tworzy środowisko programowe umożliwiające użytkownikom wykonywanie analiz i podstawowe bioinformatyki zarządzanie danymi gładkie, w połączeniu z doskonałymi graficznych opcji przeglądania i wyjściowych.Oto kilka kluczowych cech "CLC...
Seal to moduł Pythona, który zapewnia dopasowanie sekwencji na Hadoop.Pieczęć jest z MapReduce wniosek o biologicznej dopasowania sekwencji. To działa na Hadoop (http://hadoop.apache.org) poprzez Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), a Python MapReduce...
BioTools jest kilka bioinformatyki użytkowych napisanych w Pythonie Wymagania . ...
Pysam jest moduł Pythona do odczytu i manipulowania Samfiles. & Nbsp; To lekki Owijka samtools C-API.Skrócona instrukcja jest tutaj. Szczegółowa dokumentacja dostępna jest tutaj.Pytania i komentarze są mile widziane i powinny być wysłane do grupy...
. HTSeq jest ramy Python przetwarzać i analizować dane z wysokiej sekwencjonowania (HTS) Testy Wymagania : < li>...
checkmyclones jest oprogramowanie, które dostarcza narzędzi, by sprawdzić Sanger wyniki sekwencjonowania. & Nbsp; (lub zwykły tekst lub pliki FASTQ) w oparciu o zestaw sekwencji odniesienia, o ile w każdym rozsądnym formacie (w tym współrzędnych) ...
Planowanie RFLP jest narzędziem, które pomaga zaplanować eksperyment RFLP: Okazuje się, że cięcia enzymów restrykcyjnych zestaw homolog sekwencji DNA w różny sposób i symuluje żelowa wynikowy obraz elektroforezy. Program pozwala na znalezienie kluczowych...
CodonW to program przeznaczony do uproszczenia analizie wieloczynnikowej (analiza korespondencji) użytkowania kodon i aminokwasów. Oblicza także standardowe wskaźniki kodonów. Posiada zarówno menu i interfejs wiersza poleceń.Projekt CodonW został napisany...
Projekt Adun jest rozszerzalny biomolekularne program symulacji, które zawiera funkcje zarządzania i analizy danych.Adun zapewnia zaawansowane algorytmy i protokoły dla symulacji molekularnych, które mogą być dostępne z intuicyjnym interfejsem...
