RAPTOR

RAPTOR jest innowacyjne oprogramowanie przeznaczone do dokładnego przewidywania struktury białek. Łączy on w sobie zaawansowane narzędzia analizy w jednym zintegrowanym rozwiązaniu oprogramowania i zapewnia trzy różne metody gwintowania. Unikalne podejście optymalizacji programowania całkowita Raptor jest najbardziej efektywne dla znalezienia szablonów struktury celów środowiskowych z niskiej homologii sekwencji i jest w stanie generować wysokiej jakości modele. Łatwy w obsłudze interfejs i łatwe do zrozumienia wartości E są idealne dla początkujących i ekspertów. Przede wszystkim, intuicyjny wyświetlacz wyjścia pozwala użytkownikom zrozumieć wyniki tylko na pierwszy rzut oka. Biorąc pod uwagę sekwencja docelowego białka, jeśli jest homologiczne białko o znanej strukturze 3D, można znaleźć przy użyciu narzędzia wyszukiwania sekwencji jak PSI-BLAST, również przewidziany w RAPTOR. Struktura docelowego jest to zbudowany od znanej struktury; jednak, gdy homologii sekwencji nie jest znacząca, czyli mniej niż 25%, PSI-BLAST nie może wymyślić pewność trafienia. W przeciwieństwie do PSI-BLAST, który po prostu nie szukaj sekwencji, gwintowania białka, złóż uznanie, wykorzystuje zarówno struktury informacji i homologii. Skanuje sekwencję białkowy o nieznanej strukturze z bazy danych znanych konstrukcji. Za pomocą funkcji oceny punktowej i przeprowadzenie analizy zgodności pomiędzy struktur trójwymiarowych liniowych sekwencji białek, najlepiej template strukturalne będą identyfikowane z których można zbudować strukturę Sekwencji tych. W rezultacie, gwintowania białko daje lepsze prognozy niż modelowania homologii, gdy nie jest marginalna homologii sekwencji

​​ Ograniczenia .

Ograniczona funkcjonalność