Swiss-PdbViewer (aka DeepView) jest aplikacją, która zawiera interfejs użytkownika umożliwiający przyjazne analizować liczne białka w tym samym czasie. Białka mogą być nakładane w celu wyłonienia wyrównania strukturalnych i porównania ich aktywne lub innych odpowiednich części. Mutacje aminokwasu, H-obligacje, kąty i odległości między atomami są łatwe do uzyskania dzięki intuicyjnym interfejsem graficznym i menu.
Swiss-PdbViewer (aka DeepView) jest rozwijany od 1994 roku przez Nicolasa Guex. Swiss-PdbViewer jest ściśle powiązana z SWISS-MODEL, zautomatyzowany serwerze modelowania homologii opracowanego w ramach Szwajcarskiego Instytutu Bioinformatyki (SIB) w Grupie Budowlanej Bioinformatyki na Biozentrum w Bazylei.
Praca z tych dwóch programów, znacznie zmniejsza nakład pracy potrzebne do wytworzenia produkty, jak to jest możliwe, aby nić białko pierwszorzędowej sekwencji na matrycę 3D i uzyskać natychmiastową odpowiedź, jak również gwintowane białko będzie akceptowane przez struktury odniesienia przed złożeniem wniosku na budowę brakujących pętle i udoskonalić łańcuch boczny opakowania.
Swiss-PdbViewer może czytać mapy gęstości elektronów i zapewnia różne narzędzia do tworzenia się w gęstości. Ponadto, różne narzędzia do modelowania są zintegrowane i dowodzenia pliki do popularnych pakietów minimalizacji energii, mogą być generowane.
Na koniec, jako specjalny bonus, sceny POV-Ray mogą być generowane z bieżącego widoku w celu wspaniałe obrazy jakości ray tracing.
Co nowego w tym wydaniu:
- Tymina C6 atom jest poprawnie załadowany
- Naprawiono wyjście nieskończonej pętli POV-Ray w wersji PC
- sporadyczne awarii podczas zapisywania plików PDB (takich jak 2i37) na komputerze został ustalony
- Aktualizacja adres serwera mapa gęstości elektronowej w Uppsali
Komentarze nie znaleziono