Genepidgin jest zestaw narzędzi Pythona, które pomagają w nazwach produktów genów przypisanie oceny i & nbsp; Istnieją trzy podstawowe elementy.:genepidgin * czystsze *& Nbsp; ujednolica nazwy genów na wytycznych nazewnictwa UniProtgenepidgin porównaj *...
KROKI jest pakiet dla dokładnej symulacji stochastycznych systemów reakcji dyfuzji w dowolnie złożonych geometrii 3D. Nasz algorytm symulacji rdzeń jest realizacja Gillespie SSA, przedłużony do czynienia z dyfuzją cząsteczek ponad elementami 3D...
TRMiner to narzędzie Pythona, który ma na celu naukowe kuratorów danych. & Nbsp; Pozwala szybko przycinać duże zbiory publikacji naukowych kar odpowiednich dla danego celu górniczego.Osiąga się to w dwóch etapach. Po pierwsze, teksty są tranlated w ciągi...
Benchmark systemu Bioinformatyka jest próba zbudowania rozsądnej ramy badań, testów i danych, aby umożliwić użytkownikom końcowym i dostawców do badania wydajności swoich systemów.Co chcemy zrobić, to stworzyć ramy dla badań i podstawowy zestaw testów,...
Staden Package jest w pełni rozwinięty zestaw montażu sekwencji DNA (Gap4), edycji i narzędzi analitycznych (spin) dla Unix, Linux, MacOSX i MS Windows.Na froncie Gap4 było kilka łączenia związane drobneulepszenia w jaki sposób wyniki dołącza Znajdź i...
AREM jest oparty na komputerach Mac (Model analizy opartej na CHIP-seq danych).Sekwencjonowanie wysokiej przepustowości w połączeniu z chromatyny immunoterapii atmosferyczne (ChIP-Sekw) jest szeroko stosowany w charakteryzowaniu genome-wide wzorców...
seriesoftubes jest rozszerzony rurociąg opracowana przez firmę Solexa danych CHIP-nast.Pakiet dokumentacji Wymagania : ...
MetagenomeDB jest biblioteka Pythona przeznaczone do łatwego przechowywania, pobierania i opisywanie metagenomic sekwencje. & Nbsp; MetagenomeDB występować jako warstwy abstrakcji w górnej części bazy danych MongoDB. To zapewnia API do tworzenia i...
Seal to moduł Pythona, który zapewnia dopasowanie sekwencji na Hadoop.Pieczęć jest z MapReduce wniosek o biologicznej dopasowania sekwencji. To działa na Hadoop (http://hadoop.apache.org) poprzez Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), a Python MapReduce...
MISO (Mieszanina izoform) jest probabilistyczny ramy napisany w Pythonie, które quantitates poziomu ekspresji & nbsp; od genów z alternatywnego składania RNA Seq danych, oraz określa izoformy różnie regulowane lub eksonów całej próbki.Modelowania procesu...
