CaPSID

Screenshot Software:
CaPSID
Szczegóły programowe:
Wersja: 1.4.3
Filmu: 20 Feb 15
Wywoływacz: Shane Wilson
Licencja: Wolny
Popularność: 28

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

kapsydu jest kompleksowa platforma open source, która łączy o wysokiej wydajności obliczeniowej rurociągu do identyfikacji sekwencji patogenu & nbsp; i charakterystyka w ludzkich genomów i transkryptomów wraz z skalowalnej bazy danych wyników oraz aplikacji internetowej dla użytkownika do zarządzania, odpytywanie i wizualizacji wyników.
Pierwsze kroki
Musisz bazy danych MongoDB, Python 2.6+ instalację i Apache Tomcat 6+. Aby uzyskać więcej informacji, zapoznaj się z wiki:
http://wiki.github.com/capsid/capsid/home

What jest nowy w tym wydaniu:

  • Poprawki Komunikat o błędzie podczas uruchamiania odejmowanie i wyrównanie nie zostanie znaleziony,
  • Więcej pracy w sprawie ustalenia długo działające kwerendy

Co nowego w wersji 1.4.2:

  • Usuwa MongoKit zależność

Co nowego w wersji 1.4.1:

  • Poprawki Timeout kursor na długie statystyki biegania zapytań

Co nowego w wersji 1.4.0:

  • statystyka Dodaje, podczas gdy są one prowadzone, a nie wszystkie Na koniec
  • Zapisuje unikalny identyfikator dla genów jak uid

Co nowego w wersji 1.2.7:

  • Poprawki README

Co nowego w wersji 1.2.6:

  • Odejmowanie filtruje usuwane, gdy budynek odwzorowane czyta

Co nowego w wersji 1.2:

  • Narzędzie do tworzenia plików FastQ z nieodwzorowaną czyta
  • Narzędzie do powrotu przecięcie plików FastQ
  • Narzędzie do powrotu plików filtr FastQ
  • Dodane mapq próg flagi do odejmowania
  • Gbloader może teraz załadować bakterie i genomy grzybowe,
  • Zapisuje sekwencje genomu do bazy danych za pomocą GridFS
  • Zmniejszone zużycie pamięci podczas obliczania statystyk
  • w ruchu podprocesów zamiast os.system
  • wyniki mapq filtr musi zawierać 0

Co nowego w wersji 1.1:

  • Dodaje wsparcie dla pary koniec czyta

Co nowego w wersji 1.0.1:

  • Dodano wsparcie dla uwierzytelniania MongoDB,

Wymagania :

  • Python

Podobne oprogramowanie

biotools
biotools

20 Feb 15

SyntenyMiner
SyntenyMiner

3 Jun 15

pyNetConv
pyNetConv

3 Jun 15

LSim
LSim

2 Jun 15

Komentarze do CaPSID

Komentarze nie znaleziono
Dodaj komentarz
Włącz zdjęć!