Marvin

Screenshot Software:
Marvin
Szczegóły programowe:
Wersja: 5.9.4
Filmu: 14 Apr 15
Wywoływacz: ChemAxon Kft.
Licencja: Wolny
Popularność: 85

Rating: 2.0/5 (Total Votes: 1)

Projekt Marvin oferuje zestaw narzędzi Java do rysowania, wyświetlanie i charakteryzacji chemicznej struktury, podbudów i reakcje.
Marvin można łatwo zainstalować na pulpicie i zintegrowane na stronach internetowych i aplikacji firm trzecich poprzez interfejs programowania aplikacji (API).
Rodzina Marvin składa się z następujących narzędzi:
* MarvinSketch
* MarvinView
* MarvinSpace
* MolConverter

Aplety lub Fasola?

Marvin jest dostępny w dwóch pakietach, w zależności od zastosowania:
* Marvin aplety dla web developer
* Fasola Marvin na pulpicie apteki i dla deweloperów oprogramowania.
Marvin Aplety są narzędzia do budowy stron internetowych, chemicznych, które są kompatybilne z większością przeglądarek (Internet Explorer, Firefox, Safari, Opera, itp) Oferują one dostęp do / z JavaScript i są konfigurowalne przez parametry apletów.
Fasola Marvin się łatwo instalować aplikacje na pulpicie i narzędzia do integracji możliwości Marvin do dowolnej aplikacji Java

Co nowego w tym wydaniu:.

  • MarvinSketch:
  • Wykaz wg baza w chemicalize.org.
  • Możliwość zmiany kolejności ligand w MarvinSketch.
  • Efekt mgły można sterować na kilka sposobów:
  • Nie ma suwak na karcie Ekran w oknie dialogowym Preferencje w Sketch / Zobacz GUI, aby ustawić siłę efektu mgły i pole wyboru, aby wyłączyć automatyczne mgła-efekt.

  • Parametry
  • apletu i fasola są wprowadzane: fogFactor, automaticFogEnabled. (Temat na forum).
  • Mocowanie do punktu przyłączenia grupy nie powoduje automatycznego rozgrupować Sgroup więcej.
  • Oznaczanie zawartości S-grupy:. Wielokrotne i ogólne S-grupy musi zawierać cały podgrafu między obligacji przekraczających nawiasy
  • Aktualizacja zawartości S-grupy, jeśli zmiany pozycji wspornika: albo wsporniki lub struktura zostanie przeniesiona
  • .
  • osadzanie S-grupy i nakładanie są sprawdzone w cząsteczce kontroli zgodności.
  • Spryt import obsługuje alifatycznych atomów węgla z podwójnym wiązaniem (temat na forum).
  • SMILES import / eksport obsługuje allenes.
  • Generowanie tradycyjną nazwę fragmentów wewnątrz większego związku (np & quot; dekstrometorfanu bromowodorku & quot;).
  • Obsługa Numer CAS konwersji.
  • Ulepszona OCR korekcji błędów w DocumentExtractor (brakujące przecinki, rozpoznany typu nawias, dodatkowe spacje, ...).
  • Dokument Extractor dokumentów PDF daje teraz numer strony trafień.
  • Ulepszone wsparcie dla popularnych nazwisk w struktury do nazwy, a nazwa-struktury. Ogólne wsparcie dla importu wzrosła o nazwie około 5% do wspólnego i 10% na systematycznych nazw. Szybkość konwersji jest zwiększona o około 20%.
  • JChem i Marvin Fasola instalatorów dla systemu Windows wyodrębnić również skrypt dla cygwin.
  • Zachowanie grupy exocycyclic w ramach Bemis-Murcko.
  • Halogen może mieć więcej niż jedno połączenie podczas wyliczania.
  • obligacje aromatyczne są traktowane podczas obliczania liczby wiązań podwójnych kontroli własności homologii.
  • Tryb wyboru Lasso może być ustawiony jako domyślny w MSketchPane (temat na forum).
  • Nowa funkcja, isChiral został dodany do TopologyAnalyzer.
  • Nowy Chmical funkcje: isQuery Warunki (), fieldAsString ()
  • .
  • Poprawki błędów:
  • pole Nazwa nie został zaktualizowany po utworzeniu grupy, ponieważ utworzenie grupy nie zwiększyć liczbę zmian wykres niezmienny (temat na forum).
  • aplikacji MarvinSketch nie rozumiem & quot; - {nazwa} & quot; parametr wiersza poleceń.
  • Po Struktura & gt; Znajdź struktury online menu została wywołana pod Linuksem, domyślna przeglądarka nie wykryto, aby wyświetlić wynik (temat na forum).
  • ładowanie pliku isotopes.data z pamięci podręcznej java niewykonane, jeśli jego nieskompresowany wersja została zapisana w pamięci podręcznej (czyli jeśli Dekompresowanie było wykonywane automatycznie przez serwer WWW, a nie przez Marvin). Temat na forum, dokumentacja.
  • Obiekty graficzne nie są wyświetlane w oknie wyników Geometria Plugin.
  • Na strzałką przepływu elektronów, niebieskie pole dla podkreślenia był brakowało (temat na forum).
  • obciążenie Ligand nie był wyświetlany na rusztowaniu jeśli definicje zostały usunięte, nawet jeśli cali do Zawsze cali do opcja wyświetlania został ustalony na & quot; ligand zamówienia i quot; w oknie ustawień.
  • Indeks atomu został uszkodzony wieloośrodkowym po eksporcie do formatu MDL Mol jeśli został podłączony do R-grupy.
  • Strzałka przyklejone do prostokątów został uszkodzony podczas MRV importu / eksportu (temat na forum).
  • Import peptydu 1 liter nie na jednym histydyny (temat na forum).
  • Pośrednia atomy wodoru brakowało importując z SKC.
  • Wartość Null własnością MolAtom nie wywozu / przywozu w formacie MRW.
  • Poprzez import niektórych mądrość, niewłaściwy typ obligacji została ustalona zamiast jednego lub aromatycznym obligacji.
  • Pewne wsporniki importowane z plików CDX wystawione w ChemDraw były wyświetlane w złym kierunku.
  • Spryt eksport:. 1-atom sąsiad pojedyncze wiązanie aromatycznego pierścienia był eksportowany jako jednej obligacji zamiast pojedynczego / aromatycznej
  • Eksport zapytania z węzła łącza i grup R w formacie mądrość były błędne.
  • Obsługa atomów H była niejednoznaczna w mądrość wyrażeń.
  • Mol komentarz importowanego pliku pola nie powiodło się.
  • Import niektórych SMILES mylił (temat na forum).
  • szablon zawiera część łańcucha, które mogą znajdować się w miejscu docelowym jako część pierścienia lub układ pierścieniowy () powinny ignorować tę część matrycy.
  • Fine z Hydrogenize opcja Clean3D nie rozgrupowania S-grupy automatycznie (temat na forum).
  • Molecule.contractSgroups () zawiedli współrzędne cząsteczek (temat na forum).
  • atomy wodoru Jawne nie zostały odpowiednio uwzględnione w cis / trans obliczania stereochemii.
  • generator Tautomerem rzucił ArrayIndexOutOfBoundsException w niektórych przypadkach.
  • homologii wyliczenie przyniosły sprzeczne cząsteczek jakiegoś wejścia VMN.
  • Nieprawidłowe ładowanie liczyć po zastosowaniu CovalentCounterion utrwalacza.
  • Format wyjściowy dziennik linii poleceń StructureChecker różniły się od formatu wyjściowego kreatora.
  • ChiralFlagErrorChecker nie obsługiwać chiralności poprawnie. Zamiast obliczania chiralności z danych parzystości, kiedyś implementację w oparciu o metodę isChiral z TopologyAnalyser.

Co nowego w wersji 5.4.0.1:

  • Highlighting strzałki przepływu elektronów było źle, gdy podstawa lub punkt końcowy był obligacji (temat na forum).
  • Konfiguracja Menu Serialized nie działa.
  • Indeks wieloośrodkowym atomu błędnie utworzony podczas eksportu MDL MOLFile w przypadku konstrukcji, gdzie R-grupa połączonych z atomem (wieloośrodkowego zmienności pozycji obligacji).
  • brakowało niejawne wodoru z węgla po przywozie lub pasty struktur w / Symyx Szkic formatu pliku (format pliku SKC) ISIS.
  • Pliki CDX tym obróconych obiektów graficznych wywiezionych ze starej wersji ChemDraw nie mogły być importowane.
  • obliczenia Tautomerem
  • Generic tautomer nie był wystarczająco unikalny w niektórych przypadkach. Ze względu na poprawki, generic tautomerem jest formularz aromatyczny.
  • Canoncical obliczenia tautomerem została poprawiona ze względu na poprawkę z dearomatization.
  • Pewne konstrukcje z wyraźnymi atomów wodoru związanych z obligacji klina dał wyjątek podczas generycznego tautomeryzacji.
  • Obliczanie objętości brakowało cxcalc.
  • Struktura Checker rzucił NullPointerException zamiast ignorując niewłaściwy plik konfiguracji.

Co nowego w wersji 5.1.03.2:

  • IUPAC Nazwa importu: przekształcenie nazwy IUPAC struktur.
  • OLE 2 Wsparcie:. Ulepszone wsparcie wklejenia MarvinSketch przedmiotów do dokumentów biurowych MS
  • Warunki chemiczne:. Dostępne z linii poleceń w Marvin, API i może być stosowany w skryptów Java (w apletów)
  • Przyspieszony Inicjowanie MarvinSketch i MarvinView przy starcie, zarówno w wersji autonomicznej, jak i realizowanej składnika w innych aplikacjach.

Wymagania :

  • Java 2 Standard Edition Runtime Environment,

Podobne oprogramowanie

VICS-II
VICS-II

2 Jun 15

GChemPaint
GChemPaint

2 Jun 15

Fityk
Fityk

20 Feb 15

ProtoFit
ProtoFit

3 Jun 15

Komentarze do Marvin

Komentarze nie znaleziono
Dodaj komentarz
Włącz zdjęć!